El Mystery Shopping y la investigación de mercados varían ampliamente en la técnica y en el proceso. Con esto en mente, el Mystery Shopping no debe ser utilizado para sustituir la investigación de mercados, sino más bien como complemento de una organización y los conocimientos operativos. A continuación se presentan las diferencias:
El Mystery Shopping no debe utilizarse solamente para determinar la satisfacción del cliente, es un complemento que no debe de sustituir la satisfacción de los clientes tradicionales de la investigación de mercados.